花巻市城内に鎮座している神社で、創建年代は不詳です。正和2年（1313年）に再建され、天文5年（1536年）に鳥谷崎城主（稗貫氏の先祖）が城の鎮守としてあった三社を合併し、「鳥谷崎座三柱神社」と改称したと伝えられています。天正19年（1591年）に南部家の所領となり城名を花巻城と改称し、慶長年間（1600年頃）に城主・北松斎（南部信直の代官）が開戦にあたり本神社に祈願し、戦勝したので社殿を新たに造営したと言われています。明治時代に町内の三社を合祀し六祭神となり、社名を「鳥谷崎神社」と改称されました。