真ん中に久能山東照宮と書かれ、右下に駿河國久能山、真ん中に久能山東照宮の印が押されています。
杉の木を使用した御祭神徳川家康公にまつわる金の成る木御朱印もいただけます。特別夜間拝観「竹あかり」限定御朱印は、葵紋と左右の竹あかりが蓄光で暗いところで光ります。