江戸時代、足利藩主戸田家の鬼門除として奉斎したものと伝える。
東京神田神保町の五十稲荷神社は戸田家の江戸屋敷の守護神で、当社を分祀したものであるという。　五十の名称は足利地方の市日が五と十の日に開かれたことに因んで付けられた。
大正一五年、本城一丁目の無格社天神社を合祀した。

《主》稲倉魂命・菅原道真