高野山の学頭（学事を統率するもの）正了を開基とする真言宗寺院
であったが、1493（明応2）年、嘉祥寺（現在の大阪府泉南郡田尻町嘉祥寺）に
おいて本願寺第8世蓮如の教えを受け浄土真宗に改宗したという。
1524(大永4)年、本願寺第9世実如より方便法身尊像を授けられ寺号を改めた。
もと麻生郷新井村（現在の貝塚新井）にあったが、1588（天正16）年に現在地へ
移転した。明治初年まで京都の興正寺末で、麻生郷7ヵ村にあった西本願寺派の
道場を支配した。現存する本堂は、棟札から1723（享保8）年の再建で棟梁は
貝塚寺内大工の岸上六兵衛乗敬であったことがわかる。