西国三十三所の印が入った「大悲閣」、御詠歌「いくたびも　参る心ははつせ寺　山もちかいも　深き谷川」の御朱印を頒布しています。2020年12月末までは中央に「十一観音」と墨書きされている江戸時代の復刻御朱印を拝受できます。