「昔は春日山にあり、椿本の神祠という」と『大和志』には記されている。当初の祠は治承4年（1180年）の兵火で炎上し失われ、その後神木を祀るようになった。

由緒には「いつの頃からか神木の東に弁財天の小祠が設けられ、現在宗像神社として配祀されている。これはもと神宮寺の庭内社と称す。降って建治4年（1278年）興福寺の大火で再度の火難に類焼して終に現状の小祠となる」と記される。

平安遷都に伴い、この地から京都に分祀されたという。

角振隼総別命