創立年代不詳なるも紀伊国にては古き社にて、本国神明帳所載牟婁郡地祇従四位上瀧姫神は当社のことである。
伝説によれば、空海は高野山創開前弘仁元（810）年ここに真言密教の大道場を創開せんと思いしも、規模が余りに小さきため高野山に移ったという。
文安年間（1444―1448）神職峰山心海蘇原光臣は修行勧進社殿造営し中興した。
『紀伊続風土記』の古詞の条に「瀧姫神社」、又古田の条に「重山権現社」と称し氏子のいい伝で飛瀧権現ともいう。
明治6年、村社となる。
従来、重畳山神社と称していたが、重山神社と改称した。
三軒社には阿弥陀・薬師・観音を祀る。

不詳

木造神明造