昔、宮村と上田村と土地争いがあって、宮村地頭別府太郎が身をもってあたり、遂に勝訴することができたので、里人はその霊を祀って社を建てたともいわれ、あるいは鎌倉時代別府太郎なる武士がこの地で戦い、乗馬と共に深田に落ちて戦死し、里長の夢枕に「我が霊を祀らばこの地を守らん」と出たので、社を建ててこれを祀ったともいう。「武蔵名所図会」、「新編武蔵風土記稿」にも記事がある。（東京都神社名鑑より）

その由緒については『武蔵名勝図会』の記事の他、鎌倉時代の武将別府太郎祭神説もある。
江戸時代には隣地の真福寺（明治六年廃寺）がその別当であったが、明治二年以降八坂神社の神職がこれに替り祭儀を司っている。（日野市史より）

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