当社がこの地に鎮座された年は定かではないが、元応元年（1319）の「日吉社領注進記」に伊香神田の内に坂本日吉神社の分社を祀ったことが記されています。古くから当社の祭神は、安産の神として近隣や遠方からの参拝者が多く、難産で困った折には、当社境内にある井戸の水を汲み上げ、本社前に流れる小溝に水を流して社殿へ渡る小橋の下を通過すれば必ず安産になると言われています。
また、乳の出が良くない人はこの井戸水で粥を煮て食べれば乳の出が良くなるとも言われています。
大正五年（1916）六月十二日、この地でほぼ全戸が焼失した大火がありましたが当社は社殿はじめ境内のすべての建物が火災から奇跡的に難を免れ、当社に対する一層の神威を仰ぐに至りました。