天保13年（1842）に彦根藩12代藩主井伊直亮が、井伊家の始祖井伊共保の750回忌にあたり、井伊谷（現静岡県）八幡宮から井伊大明神を分霊して神像を造り、龍潭寺の参道脇に祀ったのがはじめとされます。その後弘化三年（1846）に現在の社殿が建立された。明治二年井伊神社と称し、更に昭和十四年春、近接の佐和山神社(祭神、藩祖、井伊直政、直孝両公)並びに祖霊社(祭神井伊直中、直亮、直弼その他井伊家歴代藩主)の神霊をも此に合祀した。
現在は、風化による傷みが激しいため覆いをしており、中を拝観することはできません。

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