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御祭神の大山咋神は、古事記に「この神は近つ淡海国の日枝の山（比叡山のこと）に坐し、また葛野の松尾に坐して、鳴鏑を用つ神ぞ」とあるように、神代からこの地に鎮座する。ただし、ここでいう日枝の山は小比叡すなわち八王子山（牛尾山）のことのようである。
社伝によれば、崇神天皇７年（B.C.91）八王子山頂より現在の地に遷し祀られたことを創祀とする。八王子山に鎮座する牛尾宮は東本宮の奥宮になる。
天智天皇７年（668）大和国の三輪山（大神神社）より大己貴神が勧請されると（西本宮）、大己貴神が主祭神として大宮・大比叡神と称されたのに対し、地主神として二宮・小比叡明神と称された。
貞観元年（859）には従五位下小比叡神に従五位上が奉授され（大比叡神には正二位）、元慶４年（880）には従四位上に進んだ。寿永２年（1183）には正一位に叙される。
明治になると、もともと大山咋神を祀っていたということから、大山咋神が主祭神とされ、大己貴神は摂社の扱いとなる。昭和３年（1928）、東西両本宮を同格とし、御祭神を大己貴神と大山咋神をすることとなり、現在に至る。

077-578-0009

9:00~16:30

500円

桁行五間、梁間三間、日吉造、檜皮葺

１月１日／大戸開神事（西本宮・東本宮）
２月３日／節分祭（東本宮）
11月24日／菊花祭表彰式（東本宮）

国宝
　東本宮本殿
重文　
　東本宮拝殿
　樹下神社本殿及び拝殿
　東本宮楼門