近世（1711年）曹洞宗 無得良悟が開山した黄梅山 東禅庵を「三空寺」（既存の真言宗の寺院名）と名称変更し、明治以降は「三宮寺」とした。
徳川幕府が新たに寺院を建設することを禁じたために、既存の寺院名に名称変更したと思われる。