正保２年（１６４５年）に日嚴上人（本興寺第二十二世）を開基と仰ぎ開創されております。現住職日優まで三十一世代を連綿と法燈を継承して、実に３５０年の歴史を有する法華宗の寺院であります。当山は他宗寺院のように山川に囲まれた中にあるのではなく民衆の中にあり、市井において正しい教えである法華経を弘めねばならないという立場から山号は用いておりません。
創建当時には幹の周り１丈２尺、東西に張った枝の長さ１０丈７尺、高さ３丈９尺という「妙法寺の松」と呼ばれる名高い松の木があり、天保年間（１８３０年頃）には庶民に通称「松の寺」と呼ばれて親しまれていたようです。

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