1606年、巌蓮社照誉上人により開山。
1945年の大阪大空襲にて伽藍を焼失。
1955年頃、本堂建立のため千日前法善寺と縁を結ぶ。
 千日前法善寺も空襲により伽藍を焼失しており、金毘羅堂・庫裡等は再建できていたが、本堂は未着手であったため長圓寺境内を法善寺の飛び地境内と位置づけ、1960年頃に本堂を建立。

大阪新四十八願所第37番（第48番)